En un futuro no muy lejano, la tierra es atacada constantemente por alienígenas. Los países del mundo han formado una coalición para repeler los ataques sin éxito hasta el momento.

En Japón, una organización clandestina llamada GRA opera bajo el control de la Agencia de Defensa Alienígena. Su objetivo es encontrar un modo especial de repeler los ataques alienígenas. Para ello cuenta con la ayuda de la doctora Sanada Mio que ha inventado una nueva arma llamada G-on, la máquina necesita estar en sintonía con el humano que la pilota para utilizar sus poderes de forma proporcional a la fuerza del corazón de su piloto. Los pilotos han de ser chicas jóvenes para lo que se crea una escuela especial para reclutar a las aspirantes a piloto.